โพสต์ยอดนิยม

ตัวเลือกของบรรณาธิการ - 2019

นักวิทยาศาสตร์ที่เป็นนวัตกรรมปรับปรุงระบบปิเปตแบบเก่าด้วยเทคโนโลยียุคใหม่

Anonim

นักวิจัยของ Whitehead Institute ได้นำเสนอประสิทธิภาพและความแม่นยำในระดับหนึ่งของงานวิจัยที่น่าเบื่อที่สุดที่น่าเบื่อของวิทยาศาสตร์ผู้พิพากษา: pipetting กลุ่ม บริษัท ได้จัดตั้งระบบโอเพนซอร์สซึ่งช่วยให้ทุกคนได้รับประโยชน์จากการพัฒนานี้โดยไม่คิดค่าใช้จ่าย

การโฆษณา


ขนานนามว่า "iPipet" ระบบนี้จะแปลง iPad หรือคอมพิวเตอร์แท็บเล็ตให้เป็น "ม้านั่งอัจฉริยะ" ที่แนะนำการดำเนินการของโปรโตคอลการปิเปตที่ซับซ้อน ผู้ใช้ iPipet ยังสามารถแบ่งปันการออกแบบปิเปตของพวกเขากับแต่ละอื่น ๆ กระจายความเชี่ยวชาญทั่วทั้งชุมชนการวิจัย ระบบที่สร้างโดยนักวิจัยในห้องปฏิบัติการของ Whitehead Fellow Yaniv Erlich ได้อธิบายไว้ในรายละเอียดในจดหมายที่ปรากฏในสัปดาห์นี้ในวารสาร Nature Methods

Erlich กล่าวว่าการทดลองในปัจจุบันมักอาศัยวิธีการผลิตที่มีปริมาณมากซึ่งรวมตัวอย่างจำนวนมากด้วยการออกแบบปิเปตขนาดใหญ่ที่ซับซ้อน ข้อผิดพลาดในการเกิดปิเปตอาจนำไปสู่ความล้มเหลวในการทดลอง แม้ว่าหุ่นยนต์จัดการของเหลวดูเหมือนจะเป็นทางเลือกเชิงตรรกะสำหรับงานดังกล่าว แต่ก็มีราคาแพงมากยากที่จะกำหนดโปรแกรมและต้องมีบุคลากรที่ผ่านการฝึกอบรม นอกจากนี้ยังสามารถทำให้เกิดปัญหาทางเทคนิคได้เช่นเคล็ดลับงอหรืออุดตันเพื่อไม่ให้จับของเหลวที่อยู่ใกล้กับก้นหลุมส่วนบุคคล

"เราจำเป็นต้องมีทางเลือกสำหรับหุ่นยนต์ราคาแพงที่จะช่วยให้เราสามารถใช้โปรโตคอลการปิเปตที่ซับซ้อน" Erlich กล่าว "นี่เป็นสิ่งสำคัญโดยเฉพาะอย่างยิ่งเมื่อทำงานร่วมกับกลุ่มตัวอย่างของมนุษย์ที่มักมีข้อ จำกัด "

iPipet จะให้แสงสว่างแต่ละส่วนของแผ่น 96 หรือ 384 แผ่นมาตรฐานที่วางอยู่ด้านบนของหน้าจอแท็บเล็ตซึ่งจะแนะนำผู้ใช้ผ่านการถ่ายโอนตัวอย่างหรือรีเอเจนต์จากแหล่งที่มาไปยังแผ่นปลายทางตามรูปแบบที่เฉพาะเจาะจง ผู้ใช้สร้างโปรโตคอลของตนเองในไฟล์ Microsoft Excel ในรูปแบบที่คั่นด้วยเครื่องหมายจุลภาคและอัปโหลดไปยังเว็บไซต์ iPipet (//ipipet.teamerlich.org) ซึ่งจะสร้างลิงก์ที่สามารถดาวน์โหลดได้สำหรับการดำเนินการบนคอมพิวเตอร์แท็บเล็ต รวมอยู่ในไซต์ iPipet มีการสาธิตหลากหลายและวิดีโอแนะนำ

ดังนั้น iPipet ทำงานได้ดีเพียงใด อย่างสวยงามตามที่สมาชิกของห้องปฏิบัติการ Erlich ในการทดสอบเครื่องมือกับหุ่นยนต์ควบคุมของเหลว iPipet ได้เปิดใช้ขั้นตอนการปิเปตประมาณ 3, 000 ขั้นในเวลาประมาณเจ็ดชั่วโมง หลังจากใช้เวลาอย่างมากในการสอบเทียบแล้วหุ่นยนต์ทำได้เพียงครึ่งเดียวของจำนวนขั้นตอนในเวลาเดียวกัน ในปัจจุบันมีผู้ใช้ห้องทดลองเพียงรายเดียวที่พบปัญหานี้คือเก็บแผ่นดิสก์ไว้ในตำแหน่งคงที่บนหน้าจอแท็บเล็ต ทีมงานของ Erlich ได้ให้คำตอบ: อะแดปเตอร์พลาสติก 3D ที่ผู้ใช้สามารถสร้างด้วยไฟล์ที่สามารถเข้าถึงได้ผ่านทางเว็บไซต์ iPipet

"ระบบ iPipet ทั้งหมดเป็นโอเพ่นซอร์ส" Erlich กล่าว "เราต้องการเพิ่มผลประโยชน์ให้กับชุมชนและช่วยให้พวกเขาสามารถพัฒนาอินเตอร์เฟซใหม่สำหรับคนรุ่นใหม่สำหรับการทดลองทางชีววิทยาได้"

การโฆษณา



เรื่องราวที่มา:

วัสดุจาก Whitehead Institute for Biomedical Research ต้นฉบับเขียนโดย Matt Fearer หมายเหตุ: อาจมีการแก้ไขเนื้อหาสำหรับรูปแบบและความยาว


Journal Reference :

  1. Dina Zielinski, Assaf Gordon, Benjamin L Zaks, Yaniv Erlich iPipet: การจัดการตัวอย่างโดยใช้แท็บเล็ต วิธีการทางธรรมชาติ, 2014; 11 (8): 784 ดอย: 10.1038 / nmeth.3028